脈沖布袋除塵器的脈沖式反吹法的反吹程序(即相關反吹命令的間隔時間)必須通過生產節奏及產灰量的大小進行調整，否則無法發揮出布袋除塵的效果。

比如脈沖閥開閉時間一般設定為0.2～0.3s為合適，少則脈沖閥無動作，多則浪費壓縮風資源，且反吹效果不佳。

脈沖布袋除塵器的脈沖式反吹法需要有持續的壓縮空氣來支撐脈沖噴吹工作，一旦壓縮空氣突然停止，除塵器系統壓差將會出現較大幅度的漲幅，如不及時恢復，將對除塵布袋產生嚴重破壞。

另外，如壓縮空氣中含水量較大，長期運行，會使布袋潮濕，細小的焦粉與布袋粘結導致布袋透風率急劇下降，除塵系統壓差也隨之逐漸升高，將會嚴重降低除塵效果的同時，加劇脈沖布袋除塵器布袋的損壞速度。

電磁閥進水無法正常工作，它所控制的脈沖閥、離線閥也無法動作，使得反吹效果大幅度降低，脈沖布袋除塵器效果也隨之降低，此現象冬季為明顯。